Put uzorka — od biopsije do nalaza

• 1. Uzorkovanje — biopsija, resekcija ili vađenje krvi.
• 2. Fiksacija i uklapanje u parafin (FFPE) za tkivne uzorke.
• 3. Patohistološka dijagnoza i procjena udjela tumorskih ćelija.
• 4. Odabir bloka i rezanje za molekularnu analizu.
• 5. Izolacija nukleinskih kiselina i provjera kvaliteta.
• 6. Sekvenciranje i bioinformatička obrada.
• 7. Interpretacija i izrada izvještaja.
• 8. Dostava nalaza ljekaru i razgovor s pacijentom.

• Transport uzorka između ustanova.
• Naknadno traženje bloka koji je arhiviran na drugoj lokaciji.
• Ponavljanje analize zbog nedovoljnog kvaliteta materijala.

• Predugo vrijeme do fiksacije ili predugo trajanje fiksacije.
• Dekalcifikacija jakim kiselinama kod koštanih uzoraka.
• Nizak udio tumorskih ćelija u odabranom području.

Ranije planiranje molekularnog testiranja — u trenutku postavljanja indikacije za biopsiju, a ne nakon što terapijska odluka postane hitna.