PDF · Za ljekare · 7 min čitanja
Kvalitet uzorka za NGS — preanalitički zahtjevi
Najveći dio neuspjelih NGS analiza uzrokovan je preanalitičkim faktorima, a ne samim sekvenciranjem. Ovi zahtjevi su praktični podsjetnik za kliniku i patologiju.
PDFZa ljekareAžurirano: 2026-08-02 PDF uskoro
Fiksacija
- Neutralni puferirani formalin 10%.
- Vrijeme do fiksacije što kraće; produženo hladno ishemijsko vrijeme degradira nukleinske kiseline.
- Trajanje fiksacije unutar preporučenog raspona — i prekratka i predugačka fiksacija smanjuju upotrebljivost materijala.
Udio tumorskih ćelija
- Procjenu radi patolog na obojenom rezu, uz označavanje područja za makrodisekciju.
- Nizak udio tumora glavni je uzrok lažno negativnih nalaza; navedite ga u zahtjevu i u izvještaju.
Materijal i rezovi
- Koristiti blok sa najvećim udjelom tumora, ne nužno najnoviji.
- Izbjegavati dekalcificirane uzorke obrađene jakim kiselinama.
- Citološki materijal može biti prihvatljiv ako je celularnost dovoljna i ako je metoda validirana za taj tip uzorka.
Tečna biopsija
- Epruvete namijenjene stabilizaciji cfDNA; poštovati rok i uslove transporta.
- Izbjegavati hemolizu i odgođenu obradu.
- Vrijeme uzorkovanja u odnosu na terapiju utiče na količinu detektabilne ctDNA.
Dokumentacija uz zahtjev
- Dijagnoza, stadij i klinički razlog testiranja.
- Tip uzorka, datum uzorkovanja i procijenjeni udio tumora.
- Prethodne terapije relevantne za tumačenje rezistencije.
Povezano
Slični resursi
Informacije su edukativne i ne predstavljaju individualni medicinski savjet.